Upptäck hur mitofagi känner igen och tar bort skadade mitokondrier via PINK1, Parkin, autofagosomer och lysosomal återvinning.
BLOG-ID: PB-0157
Mitofagi: hur celler identifierar och rensar bort skadade mitokondrier
Inledning
Mitokondrier producerar en stor del av den energi som cellerna behöver. Genom oxidativ fosforylering omvandlar de energi från näringsämnen till adenosintrifosfat (ATP). Mitokondrier är dock inga oföränderliga kraftverk. De utsätts ständigt för metabol belastning, förändringar i syretillgången, reaktiva syreföreningar och skador på proteiner, membran och mitokondriellt DNA.
För att fortsätta fungera väl har celler ett omfattande system för kvalitetskontroll av mitokondrier. Skadade delar kan repareras, mitokondrier kan smälta samman eller delas upp och allvarligt skadade mitokondrier kan avlägsnas selektivt.
Denna selektiva reningsprocess kallas mitofagi.
Mitofagi är en specialiserad form av autofagi där överflödiga, åldrande eller skadade mitokondrier identifieras, omsluts och slutligen bryts ned i lysosomer. De frigjorda molekylära byggstenarna kan sedan återanvändas av cellen.
Mitofagi är viktig för balansen mellan:
-
mitokondriella skador;
-
avlägsnande av mitokondrier som fungerar dåligt;
-
bildning av nya mitokondrier;
-
energiproduktion;
-
oxidativ balans;
-
cellulär anpassning till stress.
Förändringar i mitofagi undersöks bland annat inom biologiskt åldrande, neurodegeneration, kardiovaskulära processer, muskelfunktion, metabola sjukdomar och immunreglering.
Vad är mitofagi?
Ordet mitofagi består av två delar:
-
mito syftar på mitokondrier;
-
fagi betyder att äta eller bryta ned.
Mitofagi betyder bokstavligen den kontrollerade nedbrytningen av mitokondrier.
Processen hör till de selektiva formerna av makroautofagi. Vid generell autofagi bryts olika skadade eller överflödiga celldelar ned. Vid mitofagi riktar sig systemet specifikt mot mitokondrier.
Under mitofagi omges en utvald mitokondrie av ett dubbelt membran. Därigenom bildas en struktur som kallas autofagosom.
Autofagosomen smälter sedan samman med en lysosom. Lysosomer innehåller enzymer som kan bryta ned biologiska strukturer.
I lysosomen bryts bland annat följande ned:
-
mitokondriella proteiner;
-
skadade membran;
-
fosfolipider;
-
delar av mitokondriellt DNA;
-
andra mitokondriella beståndsdelar.
De frigjorda aminosyrorna, fettsyrorna och andra molekyler kan återanvändas.
Mitofagi är därför inte bara ett avfallshanteringssystem. Den är också en del av cellulär återvinning och energireglering.
Varför måste mitokondrier kontrolleras?
Mitokondrier utför flera viktiga funktioner.
De medverkar i:
-
ATP-produktion;
-
fettoxidation;
-
kalciumreglering;
-
produktion och reglering av reaktiva syreföreningar;
-
syntes av vissa molekyler;
-
cellulära stressreaktioner;
-
programmerad celldöd.
Under energiproduktionen rör sig elektroner genom elektrontransportkedjan. En liten del av dessa elektroner kan läcka ut i förtid och bidra till bildningen av reaktiva syreföreningar.
I kontrollerade mängder fungerar dessa molekyler som signalämnen. När produktionen under lång tid överstiger den antioxidativa kapaciteten kan oxidativ stress uppstå.
Skadade mitokondrier kan:
-
producera mindre ATP;
-
bilda mer reaktiva syreföreningar;
-
förlora sin membranpotential;
-
reglera kalcium mindre effektivt;
-
påverka inflammationssignaler;
-
frigöra skadat mitokondriellt material.
Elimineringen av allvarligt skadade mitokondrier bidrar till att förhindra att mitokondriella skador ansamlas ytterligare.
Mitokondriell kvalitetskontroll
Mitofagi utgör endast en del av ett större kvalitetskontrollsystem.
Mitokondrier använder olika mekanismer för att upprätthålla sin funktion:
1. Mitokondriell proteinkvalitetskontroll
Skadade eller felveckade proteiner kan kännas igen och brytas ned av mitokondriella proteaser.
2. Mitokondriell fusion
Vid fusion kopplas mitokondrier samman.
Därigenom kan mitokondriella beståndsdelar utbytas. En delvis skadad mitokondrie kan eventuellt stödjas genom att kopplas samman med en bättre fungerande mitokondrie.
3. Mitokondriell klyvning
Vid mitokondriell klyvning, även kallad fission, delas en mitokondrie.
På så sätt kan skadade delar avskiljas från den bättre fungerande delen av det mitokondriella nätverket.
4. Mitofagi
När skadan inte kan repareras tillräckligt kan den skadade mitokondrien väljas ut för nedbrytning.
5. Mitokondriell biogenes
Nya mitokondriella beståndsdelar bildas och det mitokondriella nätverket förnyas.
En frisk mitokondriepopulation är därför beroende av en dynamisk balans mellan reparation, fusion, klyvning, eliminering och förnyelse.
Hur känner en cell igen en skadad mitokondrie?
En viktig signal är förändring eller förlust av mitokondriets membranpotential.
Mitokondriets inre membran har en elektrokemisk spänningsskillnad. Denna membranpotential är nödvändig för en effektiv produktion av ATP.
När en mitokondrie skadas allvarligt kan membranpotentialen minska.
Cellen kan känna igen denna förändring via specialiserade proteiner.
Den mest välstuderade vägen är:
PINK1–Parkin-signalvägen
PINK1 står för:
PTEN-induced kinase 1
Parkin är ett E3-ubiquitinligas som kodas av PRKN-genen.
Tillsammans fungerar PINK1 och Parkin som delar av ett mitokondriellt kontrollsystem.
PINK1 i friska mitokondrier
I ett friskt mitokondrium transporteras PINK1 kontinuerligt in i mitokondriet.
Tack vare den normala membranpotentialen kan PINK1 passera mitokondriets membran via specialiserade transportkomplex.
Proteinet bearbetas och bryts sedan ned.
På så sätt förblir mängden PINK1 på det yttre membranet hos friska mitokondrier låg.
Den kontinuerliga nedbrytningen av PINK1 fungerar som en slags kontrollsignal:
den mitokondriella membranpotentialen fungerar och mitokondriet uppvisar ingen tydlig larmsignal.
Vad händer när membranpotentialen försvinner?
När membranpotentialen minskar kraftigt kan PINK1 inte längre importeras normalt.
PINK1 ansamlas sedan på utsidan av det skadade mitokondriet.
Där aktiverar PINK1 flera processer:
-
PINK1 stabiliseras på mitokondriets yttre membran.
-
PINK1 fosforylerar ubiquitin.
-
Parkin rekryteras och aktiveras.
-
Parkin fäster ytterligare ubiquitinmolekyler på proteiner i mitokondriets yttre membran.
-
Ubiquitinsignalerna känns igen av autofagiadapterproteiner.
-
Det skadade mitokondriet kopplas till den autofagiska apparaten.
Detta bildar en förstärkande signal som markerar det skadade mitokondriet för eliminering.
Vad är ubiquitin?
Ubiquitin är ett litet reglerande protein.
Celler kan koppla ubiquitinmolekyler till andra proteiner. På så sätt uppstår en molekylär märkning.
Beroende på ubiquitinkedjans plats och struktur kan märkningen ha olika betydelser.
Ubiquitin kan bland annat signalera att:
-
ett protein måste brytas ned;
-
ett protein måste flyttas till en annan plats;
-
en skadad celldel måste kännas igen;
-
autofagiska processer måste aktiveras.
Under PINK1–Parkin-medierad mitofagi förses flera proteiner på mitokondriets yttre membran med ubiquitinmarkeringar.
Dessa markeringar hjälper autofagiadapterproteiner att känna igen det skadade mitokondriet.
Autofagiadapterproteinernas roll
Ubiquitinmarkeringar känns igen av specialiserade adapterproteiner.
Exempel är:
-
OPTN;
-
NDP52;
-
p62;
-
NBR1;
-
TAX1BP1.
Dessa adapterproteiner kan binda till proteiner ur LC3/GABARAP-familjen på det växande autofagosomala membranet.
På så sätt uppstår en fysisk koppling mellan:
-
det markerade mitokondriet;
-
den autofagiska apparaten;
-
membranet som ska omsluta mitokondriet.
Det skadade mitokondriet omgesluts sedan gradvis allt mer.
Vad är en autofagosom?
En autofagosom är en tillfällig struktur med ett dubbelt membran.
Membranet växer runt det utvalda mitokondriet tills det är helt omslutet.
Den bildade autofagosomen transporterar det mitokondriella materialet till det lysosomala nedbrytningssystemet.
Bildandet av en autofagosom kräver samverkan mellan flera autofagirelaterade proteiner.
Viktiga komponenter är bland annat:
-
ULK-komplex;
-
Beclin-1-relaterade komplex;
-
ATG-proteiner;
-
LC3- och GABARAP-proteiner.
Mitofagi är därför inte en separat reaktion, utan en organiserad process där mitokondriell signalering och allmänna autofagimekanismer samverkar.
Nedbrytning i lysosomen
När mitokondrien har omslutits helt fusionerar autofagosomen med ett lysosom.
Därigenom bildas ett autolysosom.
Lysosomala enzymer bryter ner det mitokondriella materialet.
Nedbrytningsprodukterna kan återanvändas för:
-
proteinsyntes;
-
membranbildning;
-
energiproduktion;
-
andra metabola processer.
Hela förloppet från igenkänning till nedbrytning kallas mitofagiskt flöde.
Att endast mäta antalet autofagosomer räcker därför inte för att fastställa om mitofagin faktiskt har ökat.
Många autofagosomer kan nämligen också bildas när det sista nedbrytningssteget inte fungerar korrekt.
PINK1 och Parkin är inte den enda mitofagivägen
Även om PINK1–Parkin-vägen är den mest kända mekanismen finns det också andra former av mitofagi.
Vissa mitokondrieproteiner kan direkt ansluta till den autofagiska maskinerin.
Exempel på mitofagireceptorer är:
-
BNIP3;
-
NIX, även känt som BNIP3L;
-
FUNDC1;
-
BCL2L13;
-
FKBP8.
Dessa receptorer innehåller ofta en LC3-interagerande region.
Därigenom kan de binda direkt till LC3- eller GABARAP-proteiner.
Receptorberoende mitofagi kan vara viktig vid:
-
syrebrist;
-
utveckling av röda blodkroppar;
-
cellulär differentiering;
-
metabol anpassning;
-
vävnadsspecifika stressreaktioner.
Mitofagi under utvecklingen av röda blodkroppar
Mogna röda blodkroppar innehåller inga mitokondrier.
Under utvecklingen måste därför prekursorceller avlägsna sina mitokondrier.
NIX spelar en viktig roll i denna process.
Detta visar att mitofagi inte bara rensar bort skadade mitokondrier. Processen kan också användas för att kontrollerat avlägsna friska mitokondrier när en celltyp inte längre behöver dem.
Mitofagi är alltså involverad i både kvalitetskontroll och normal cellulär utveckling.
Mitofagi och oxidativ stress
Skadade mitokondrier kan uppvisa en ökad produktion av reaktiva syreföreningar.
När dessa mitokondrier inte avlägsnas kan den oxidativa belastningen öka.
Mitofagi kan bidra till oxidativ balans genom att selektivt bryta ned dåligt fungerande mitokondrier.
Sambandet är dock inte enkelt.
En begränsad mängd reaktiva syreföreningar kan aktivera mitofagisignaler. Allvarliga eller långvariga oxidativa skador kan däremot också störa autofagiska och lysosomala processer.
Det biologiska utfallet beror på:
-
stressens intensitet;
-
stressens varaktighet;
-
celltypen;
-
mitokondriernas tillstånd;
-
den tillgängliga antioxidativa kapaciteten.
Mitofagi och mitokondriell biogenes
Borttagning av skadade mitokondrier är bara den ena halvan av mitokondriell förnyelse.
Nya mitokondriella komponenter måste också bildas.
Denna process kallas mitokondriell biogenes.
PGC-1α beskrivs ofta som en viktig regulator av mitokondriell biogenes.
PGC-1α påverkar bland annat:
-
mitokondriell genuttryck;
-
bildning av mitokondriella proteiner;
-
oxidativ metabolism;
-
anpassning till energibehov.
Ett friskt mitokondriellt nätverk kräver sannolikt god samordning mellan:
mitofagi → borttagning
och
biogenes → förnyelse
När endast borttagning sker utan tillräcklig förnyelse kan den totala mitokondriella kapaciteten minska.
När endast nya mitokondriella komponenter bildas utan god kvalitetskontroll kan skadade mitokondrier ansamlas.
Mitofagi och biologiskt åldrande
Under biologiskt åldrande kan förändringar uppstå i:
-
mitokondriell membranpotential;
-
mitokondrie-DNA;
-
ATP-produktion;
-
oxidativ balans;
-
lysosomal funktion;
-
autofagisk aktivitet;
-
mitokondriell dynamik.
Flera experimentella modeller visar att den mitofagiska effektiviteten kan förändras under åldrandet.
Minskad borttagning av skadade mitokondrier kan bidra till att mitokondriella skador ansamlas.
Samtidigt är åldrande en komplex process. Förändringar i mitofagi kan vara både orsak till och följd av andra cellulära förändringar.
Det är därför alltför förenklat att enbart förklara åldrande med en minskning av mitofagi.
Mitofagi och neurodegenerativ forskning
Hjärnceller är starkt beroende av mitokondriell energiproduktion.
Neuroner kan ha mycket långa utskott. Därför måste mitokondrier transporteras över stora avstånd till platser med stort energibehov.
Förändringar i mitokondriell kvalitetskontroll studeras vid flera neurodegenerativa sjukdomar.
PINK1- och PRKN-generna är särskilt relevanta eftersom vissa genetiska förändringar är kopplade till ärftliga former av tidigt debuterande Parkinsons sjukdom.
Studerade processer omfattar bland annat:
-
minskad borttagning av skadade mitokondrier;
-
förändringar i mitokondriell transport;
-
oxidativ stress;
-
avvikande proteinansamling;
-
förändringar i neuronal energiproduktion.
Detta innebär inte att generell stimulering av mitofagi är en bevisad behandling.
Neuroner har en komplex mitokondriell organisation, och forskningsresultat från cellmodeller kan inte direkt översättas till kliniska effekter.
Mitofagi och kardiovaskulär forskning
Hjärtmuskelceller behöver ständigt stora mängder ATP.
En god mitokondriefunktion är därför viktig för hjärtats energiförsörjning.
Mitofagi undersöks inom modeller för:
-
kardiologiskt åldrande;
-
ischemi;
-
reperfusionsskada;
-
oxidativ belastning;
-
förändringar i hjärtmuskelfunktionen.
Vid ischemi får vävnaden tillfälligt mindre syre.
När blodflödet återställs kan kraftiga förändringar uppstå i mitokondriella oxidativa processer.
Mitofagi kan under vissa omständigheter bidra till avlägsnandet av skadade mitokondrier.
Både för liten och överdriven mitokondriell nedbrytning kan dock vara ogynnsam. Tidpunkten och regleringen är därför viktiga.
Mitofagi och metabol hälsa
Mitokondrier spelar en central roll i:
-
glukosoxidation;
-
fettoxidation;
-
metabol flexibilitet;
-
värmeproduktion;
-
cellulär energireglering.
Förändringar i mitokondriell kvalitetskontroll undersöks vid:
-
fetma;
-
insulinresistens;
-
typ 2-diabetes;
-
metabola syndromet;
-
metabol leverförfettning.
Skadade mitokondrier kan påverka oxidativa processer och metabol signalering.
Sambandet mellan mitofagi och metabol hälsa varierar dock mellan olika organ.
En förändring som är gynnsam i muskelvävnad behöver inte ha samma effekt i lever-, fett- eller bukspottkörtelceller.
Mitofagi och immunsystemet
Mitokondrier påverkar flera immunprocesser.
Skadade mitokondrier kan frigöra molekyler som känns igen av cellen som faresignaler.
Exempel är:
-
mitokondrie-DNA;
-
reaktiva syreföreningar;
-
mitokondriella membrankomponenter.
Dessa signaler kan påverka inflammationsvägar.
Mitofagi kan bidra till att avlägsna skadade mitokondrier innan stora mängder mitokondriella faresignaler frigörs.
Därför undersöks mitofagi i relation till:
-
medfödd immunitet;
-
inflammatorisk signalering;
-
inflammasomaktivering;
-
immunologiskt åldrande.
Mitofagi är dock inte enkelt antiinflammatoriskt. Utfallet beror på celltypen, orsaken till den mitokondriella skadan och den involverade signalvägen.
Mitofagi och muskelvävnad
Muskelceller behöver många mitokondrier för energiproduktion.
Under fysisk aktivitet förändras energibehovet kraftigt.
Träning kan påverka signaler som är involverade i:
-
mitokondriell biogenes;
-
mitokondriell fusion;
-
mitokondriell fission;
-
autofagi;
-
mitofagi.
På så sätt kan det mitokondriella nätverket anpassa sig till upprepad metabol belastning.
Mitofagi studeras som en del av muskelanpassning, muskelåldrande och bevarandet av mitokondriell kvalitet.
Mer mitofagi är dock inte automatiskt bättre.
En funktionell balans mellan eliminering och förnyelse är fortfarande nödvändig.
Kan mitofagi mätas?
Mitofagi är svår att mäta eftersom det är en dynamisk process.
Forskare använder bland annat:
-
fluorescensmikroskopi;
-
mitokondriella markörer;
-
LC3-markörer;
-
lysosomala markörer;
-
elektronmikroskopi;
-
genetiska reportergener;
-
mitokondrieriktade pH-sensorer.
Exempel på specialiserade reportergener är mt-Keima och mito-QC.
Dessa tekniker kan hjälpa till att avgöra om mitokondriellt material faktiskt hamnar i en sur lysosomal miljö.
En viktig utmaning är att skilja mellan:
-
ökad bildning av autofagosomer;
-
ökad nedbrytning;
-
blockering av lysosomal nedbrytning.
Därför är det viktigt att mäta det fullständiga mitofagiska flödet.
Är mer mitofagi alltid gynnsamt?
Nej.
Mitofagi är en reglerad balansprocess.
För lite mitofagi kan leda till ansamling av skadade mitokondrier.
Överdriven eliminering av mitokondrier kan leda till:
-
förlust av mitokondriell massa;
-
minskad ATP-kapacitet;
-
metabol störning;
-
ökad cellulär stress.
Den optimala aktiviteten varierar beroende på:
-
celltyp;
-
organ;
-
ålder;
-
energibehov;
-
stressnivå;
-
sjukdomsprocess.
Därför fokuserar vetenskaplig forskning allt mer på att återställa balansen i stället för att maximera aktiveringen av en enskild väg.
Mitofagi som ett möjligt forskningsmål
Olika forskargrupper studerar sätt att påverka mitokondriell kvalitetskontroll.
Möjliga forskningsinriktningar är:
-
påverkan på PINK1;
-
aktivering eller reglering av Parkin;
-
hämning av deubikvitinerande enzymer;
-
påverkan på mitofagireceptorer;
-
stöd för lysosomal funktion;
-
reglering av mitokondriell biogenes.
Även om dessa vägar är biologiskt intressanta är klinisk översättning fortfarande komplex.
En molekylär förbättring i en cellmodell innebär inte automatiskt att symtom, organfunktion eller sjukdomsutfall hos människor förbättras.
Begränsningar i den aktuella forskningen
Viktiga begränsningar är:
-
mycket forskning har utförts på celler och djur;
-
artificiell mitokondriell skada kan skilja sig från sjukdomsprocesser hos människor;
-
olika vävnader använder olika mitofagivägar;
-
PINK1–Parkin är inte den enda vägen;
-
mitofagi är svårt att mäta direkt hos människor;
-
mer mitofagi är inte automatiskt gynnsamt;
-
Förändringar i markörer visar inte alltid ett högre mitofagiskt flöde;
-
Långtidseffekterna av riktad påverkan är ännu inte helt kända.
Vetenskapliga resultat måste därför bedömas i sitt sammanhang och utifrån den använda forskningsmodellen.
Slutsats
Mitofagi är den selektiva process genom vilken celler känner igen och bryter ner överflödiga, åldrande eller skadade mitokondrier.
Det utgör en viktig del av den mitokondriella kvalitetskontrollen.
PINK1–Parkin-vägen är den mest kända mekanismen. Vid förlust av mitokondriell membranpotential ansamlas PINK1 på utsidan av den skadade mitokondrien. PINK1 aktiverar Parkin, varefter mitokondriella proteiner förses med ubiquitinmarkeringar.
Autofagiadapterproteiner känner igen dessa signaler och kopplar mitokondrien till den autofagiska maskineriet.
Mitokondrien omsluts därefter i en autofagosom och bryts ner genom lysosomala processer.
Utöver PINK1 och Parkin finns receptorberoende vägar där proteiner som BNIP3, NIX och FUNDC1 deltar.
Mitofagi samverkar med mitokondriell fusion, fission och biogenes. Ett friskt mitokondriellt nätverk kräver en balans mellan avlägsnande och förnyelse.
Förändringar i mitofagi undersöks inom biologiskt åldrande, neurodegeneration, kardiovaskulära processer, metabol hälsa, muskelfunktion och immunreglering.
Även om mitofagi är ett viktigt forskningsområde innebär en biologiskt plausibel mekanism inte automatiskt att riktad stimulering är kliniskt effektiv eller säker.
Sammanfattning
Mitofagi är en selektiv form av autofagi där skadade eller överflödiga mitokondrier avlägsnas. PINK1–Parkin-vägen känner bland annat igen förlust av mitokondriell membranpotential och märker skadade mitokondrier med ubiquitin. Autofagosomer omsluter den utvalda mitokondrien, varefter lysosomer bryter ner och återvinner materialet. Mitofagi stödjer mitokondriell kvalitetskontroll, men måste förbli i balans med mitokondriell biogenes.
Forskningsfriskrivning
Denna information är uteslutande avsedd för utbildnings- och vetenskapliga ändamål. De mekanismer som diskuteras är inte avsedda som medicinsk rådgivning och får inte tolkas som bevisad diagnos, behandling, förebyggande åtgärd eller bot för något sjukdomstillstånd. Peptideras forskningsprodukter är uteslutande avsedda för Research Use Only (RUO) och inte för mänsklig konsumtion.
Relaterade Peptidera-produkter:
SS-31
MOTS-c
NAD+
Rekommenderade interna länkar:
-
Vad är kardiolipin?
-
Vad är SS-31 och hur undersöks det?
-
Mitokondrier och cellulär energiproduktion
-
MOTS-c och mitokondriell signalering
-
NAD⁺ och den cellulära energimetabolismen
-
Oxidativ stress och mitokondriella skador